Witaj, nie wiem nic o środkach chemicznych, ale wątpię by miały dobry wpływ na cały ekosystem jeziora.
Najlepszy sposób to usunięcie mechaniczne. Jeśli jezioro jest płytkie to możesz to zrobić samemu. Wystarczy śćiąć trzcinę jak najbliżej dna, a bulwy - korzenie należy wygrabić. Jeśli coś odrośnie to trzeba ponownie przeprowadzić oczyszczanie.
Natomiast jeśli Cię stać to możesz wynająć specjalistyczną firmę, która dysponuje sprzętem w rodzaju kombajnu